当他和伙伴们路过某个球场时，刚好看到赤木晴 子在这里练习投球。就在此时，一台机车飞驰冲入球场，头戴安全帽的骑手腾空而起，绝杀灌篮。此人是津久武高中篮球部一年级新生南乡桄一郎，他不仅对樱木的头槌无动于衷，更具有令众人无法轻视的实力。接下来一场，湘北篮球队遇上了强劲对手津久武…… 本片根据井上雄彦的同名漫画改编，为该动画的第二部剧场版。
Wille指示Akira（由Yuko Miyamura配音）和Shinri（由Masayama Sakamoto配音）夺回被封在卫星轨道上的Choku飞船和Hina Shinji（由Keimei Ogata配音），但Shinji被绝对禁止登上Choku飞船。无知的真嗣感受到了周围的敌意，跟随Ayanami（由Hyumi Lin配音）登上了突然入侵的9号航班，回到了千疮百孔的NERV总部。在这里，他意外地与朝思叶心目中的Ayanami重聚。他还从父亲那里得知，他将与漂亮的年轻人石田正久一起驾驶第13架飞机。时隔14年，其间的沧桑和情感纠葛让真嗣不知所措。看似温和的长崎为他揭示了各种不可思议的真相。。。这部电影是长荣新剧场版三部曲的第三部。
