27岁的上班族河地大吉（松山健一 饰）赶回家乡参加外公的葬礼，意外见到了外公的私生女——美丽而可怜的鹿贺凛（芦田爱菜 饰）。凛自然无法得到鹿贺家族的认可，却引起了大吉的关注与同情。最终，大吉将这个年仅6岁、尚在尿床的小阿姨带回东京独自抚养。
晓石晓晓（由水川顺一配音）就读于私立藤见高中二年级。那一天，他正在享受校园里悠闲祥和的生活。突然，一个异物闯入，使学校成为一个充满血腥和悲剧的舞台。一种被称为“尸体”的怪物包围着校园，它们狂野、嗜血，拥有一具坚不可摧的身体。
全人类因谜般的现象而在一瞬间石化，之后过了数千年——。 拥有超越人类的头脑，天生的科学少年·千空苏醒了。 “从石器时代到现代文明，要跨越这科学史上的200万年！”。
