鸣海孝之（谷山纪章 配音）、平慎二（青木城 配音）和速濑水月（石桥朋子 配音）是学生时代的好友，毕业在即，三人亦即将奔向不同的未来。某日，鸣海孝之结识了名叫凉宫遥（栗林美奈实 配音）的少女，在速濑水月的牵线搭桥下，鸣海孝之和凉宫遥走到了一起。
《同一屋檐下1》的余晖在播出四年后依然存在，因此第二集得以上映。这一集的主线不再是关于哥哥如何为兄弟姐妹工作。相反，它穿插了一些感人的情节。虽然没有前一集那么自然，但这一集的真相仍然让这部剧非常动人。
之后，小五郎被捕。柯南发现安室多出现在爆炸现场并受伤。为了回报毛利叔叔的清白，柯南、阿里博士和少年侦探队的年轻同伴们组队调查现场并收集证据。随着调查的深入，柯南发现这起爆炸案隐藏了包括恐怖分子和公共安全在内的多方之间的复杂关系，真相更让所有人震惊。。。这部电影是“名侦探柯南系列”的第22部动画剧场版，总票房收入超过90亿日元。
